Colloquim 2012
| 日 | 発表者・論文・概要 | |
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| 2月20日 | Shiwei Zhu | Motaleb MA, et al(2011) |
| Diverse function of FliL in different bacteria: In different bacteria, FliL has a common character enhancing swarming ability. However, Jun proposed that different orientation of flagella due to absence of FliL results in a defect in swarming. Concerning itself role, there are several understandings.The paper 5 suggest that the FliL is helpful for overcoming friction and facilitating colony hydration during swaring in the Salmonella. Besides, the paper 6 suggest that FliL is dependent on viscosity and required some extra-gene’s favor in the Proteus. |
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| 1月16日 | 本間 道夫 | Sun M, et al(2011) |
| 細菌のgliding運動のミステリアスな運動機構（細胞表面波、フォーカル接合点移動、ムカデの足様運動、尺取り虫様運動、スライムジェット流などの仮説）： 粘液細菌と呼ばれるグラム陰性の土壌細菌であるミクソコッカス(Myxococcus xanthus)で、最近、細胞表層をプロトン駆動力でらせんに動くタンパク質があることがわかった。 |
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| 1月9日 | 小嶋 誠司 | Stefanovic S, et al(2007) |
| Tail-anchored(TA)proteinのER膜への挿入の仕組み： ① TA proteinをER膜へターゲットするシャペロンTRC40の発見 ② Get1, Get2とGet3によるTA protein insertionの仕組み（構造と再構成） ③ TA protein insertionの総説 （歴史も書かれており、非常にわかりやすい：推奨） |
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| 12月12日 | 大羽 哲也 | Uenoyama A, et al(2005) |
| マイコプラズマの滑走運動について： | ||
| 12月05日 | 米田 拓郎 | Kanjee U, et al(2011) |
| 緊縮応答（Stringent Response）とppGpp： 構造から分かった新しいppGppの制御メカニズム |
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| 11月21日 | 西垣 岳彦 | Schofield WB, et al(2010) |
| コレラで見つかったParAファミリータンパク質を極にアンカーするHubP： ①コーロバクターの染色体分配に関わるParAと関連タンパク質 ②走化性因子をリクルートするParC ③ParAファミリータンパク質ParA, ParC, FlhGの局在を制御するHubP |
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| 11月7日 | 竹川 宣宏 | |
| 好圧菌(piezophilic bacteria): 高圧条件で酵素などが働くしくみを理解したい。 | ||
| 10月31日 | 小林 詩織 | |
| 腸内細菌叢と大腸ガンの関係 | ||
| 10月24日 | 岸 孝亮 | |
| 植物の根と相互作用する菌：植物と菌との間での栄養のやりとりで共力をする | ||
| 10月17日 | 小野 宏樹 | |
| Sojのconformation変化とDNA複製開始制御：DnaAとの相互作用による制御機構 | ||
| 10月11日 | 堀田 秀麿 | |
| Helicobacter pyloriの感染によるミトコンドリアの変化：毒素タンパク質VacAの役割 | ||
| 10月3日 | 西野 優紀 | |
| 細菌の植物に対するroot colonizationとhns, biofilmの関係を定量PCRによって調べた | ||
| 9月26日 | 森 安梨沙 | |
| Psedomonas putida WCS358のQuoram Sensing RegulatorであるRsaLの機能と構造 | ||
| 7月11日 | 小嶋 誠司 | Wu W, et al(2011) |
| MinEによるMinD ATPase活性の制御：構造からの解釈 ①大腸菌MinD二量体の結晶構造と変異解析 ②大腸菌MinD-MinE複合体の結晶構造と変異解析（ターザンモデル） ③MinEによるMinD ATPase活性化機構 |
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| 7月4日 | Shiwei Zhu | |
| Helicobacter pylori infection and host defense: ① Urel is crucial for acid resistance ② a defense mechanism of our stomach for prevent H.pylori |
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| 6月27日 | 郷原 瑞樹 | |
| クモの糸: ① 蚕の発現系 ② 遺伝子組み換え蚕は繭の中にタンパクを織り込む ③ 遺伝子組み換え蚕は繭の中にクモの糸を織り込む |
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| 6月20日 | 本間 道夫 | van Dam V, et al(2007) |
| ペプチドグリカン合成と分解についての論文を調べてみました。全体像とFtsWがリピッドIIのフリッパーゼではないかという最新の知見を紹介します。論文が多くて、遺伝子も多くて、閉口しました | ||
| 6月6日 | 西野 優紀 | |
| サルモネラ菌べん毛モーターへの固定子の集合には、MotAの細胞内ループ領域に存在する荷電残基が必要である。 | ||
| 森 安梨沙 | ||
| Optogenetics toolとして利用されるChannelrhodopsin-2(ChR2)の機能とモデル： ChR2のモデル構造に基づいた変異導入実験により、ChR2内のイオン透過経路やイオン選択性の解析が行われた。 | 5月30日 | 小野 宏樹 |
| 両毛性であるC.jejuniにおける細胞分裂の制御：MinDホモログであるFlhGが細胞分裂に関与しているらしい。FlhGの変異でミニセルができる。 | ||
| 堀田 秀麿 | ||
| Escherichia coliのFtsZ ring形成に関与する因子ZapC：ZapCはmidcellでFtsZと相互作用している | ||
| 5月23日 | 米田 拓郎 | Lupp C, et al (2005) |
発光バクテリアVibrio fischeriについていろいろ：発光の制御はquorum-sensingシステムやredox-responsiveシステムによって行われる |
5月16日 | 西垣 岳彦 | Daly MJ, et al (2004) |
放射線耐性菌Deinococcus radiodurans：Mnに依存的に放射線耐性を示し、タンパク質酸化に対する耐性が重要らしいことが示された。高いDNA修復能が重要であることも示されている。 |
5月9日 | 大羽 哲也 | Kim HE, et al (2005) |
アポトーシスのざっくりとした話： |
5月2日 | 岸 孝亮 | Dong X, et al (1997) |
Drosophilaの細胞周期を制御するrca1とcycA： |
4月25日 | 小林 詩織 | Waight AB, et al (2010) |
ギ酸/亜硝酸輸送体ファミリーについて： |
4月18日 | 竹川 宣宏 | Whitchurch CB, et al (1998) |
バイオフィルムのお話： |
4月10日 | 郷原 瑞樹 |
胃で生き延びる～大腸菌の酸耐性～ アミノ酸アンチポーターの構造決定の洞察： |
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