Colloquim 2013

Bowman GR, et al (2008)
Laloux G, et al (2013)
Laloux G, et al (2014)

〜Caulobacterのcell biology〜　染色体分配を助けるPopZの極局在メカニズム：
�@PopZの発見
�APopZのフィラメント形成が極局在のカギとなる
�Bなぜ蛋白質が極局在するのか？

Inaba K, et al (2008)
Li X, et al (2009)
Hizukuri Y, et al (2012)

大腸菌のストレス応答シグナル伝達σ^E経路におけるRseAのSite-2切断制御について：
�@RseAのSite-2の切断におけるRsePの２つのPDZドメインの制御
�ARsePの切断にはRseAのVal148が重要である
�Bin vivoのRsePによるRseAの切断の認識にRsePの特定のアミノ酸残基は必須ではない

Bonanni PS, et al (2012)
Clarke TA, et al (2011)
Breuer M, et al (2012)

発電する細菌：Shewanella oneidenisisの発電を可能にする膜に存在するタンパク質の構造と機能(MtrF)

Wang YK, et al (2010)
Ran LY, et al (2013)

深海バクテリアから分泌されるコラーゲン分解性セリンプロテアーゼMCP-01について：
�@MCP-01のPKDドメインについて
�AMCP-01のコラーゲン分解メカニズムについて

Sugimoto TN, et al (2012)
Hosokawa T, et al (2010)
Werren JH, et al (2008)

節足動物やフィラリア線虫に共生するWolbachia属細菌：
ガの性決定を改変したり、トコジラミの栄養器官として機能する。

Burre´ J, et al (2010)
Shi L, et al (2012)
Rizo J, et al (2012)

シナプス小胞輸送と関連タンパク質：
α-シンクレインがSNARE複合体の集合を促進する事がわかった。またSNARE複合体は１つで融合し、３個以上でポアを開けるらしい。

Montminy SW, et al (2006)
Cirl C, et al (2008)

宿主のリポ多糖(LPS)認識機構vsグラム陰性菌：
�@37℃で培養したペスト菌のlipid AはTLR4（Toll-like receptor-4）の活性化を阻害する
�A尿路病原性大腸菌のタンパク質TcpCはTLRのシグナル伝達を阻害する

Siponen MI, et al (2013)
Komeili A. (2012)

磁性細菌が持つ磁石：
マグネトソーム形成の分子メカニズム に関するほんの一部分のお話

Kainosho M, et al (2006)
Miyanoiri Y, et al (2012)

NMRとSAILアミノ酸：
タンパク質の構造とダイナミクス研究のための立体整列同位体標識法

Duke TA, et al (2001)
Bai F, et al (2010)

高分解能の光学顕微鏡を用いた細菌鞭毛の回転計測により、モータースイッチ複合体に関する複数状態のスイッチングを検出した。高次構造の伝播モデルによるサブユニット間及びサブユニットとリガンド間の高次構造の結合が確率論的に生じていることが示唆されていた。この高次構造伝播モデルにより、スイッチングを説明できる。

Bonsor DA, et al (2009)
Li C, et al (2012)

コリシンE9やAがTol-Pal系を介して毒性を出す機構

Lummis SC, et al (2005)
Valiyaveetil FI, et al (2004)
Valiyaveetil FI, et al (2006)

非天然アミノ酸を用いた膜蛋白質の解析

Tsukamoto T, et al (2013)

�@　真正細菌由来グロエオバクターロドプシンは、界面活性剤および細胞膜中で三量体を形成する。
�A　三量体構造はpH依存的に転移する。
�B　三量体から単量体への解離は、プロトンアクセプターAsp121のプロトン化が引き金となる。
�C　Asp121と相互作用するHis87は、三量体形成に必須の残基である。
�D　GRのプロトン輸送反応は、三量体構造を変化させる大きな構造変化を伴う可能性がある。

Boehm A, et al (2009)
Steiner S, et al (2013)

バイオフィルム形成：EPS合成酵素複合体にc-di-GMPが作用する：
�@リボソームに作用する抗生物質によってc-di-GMP依存的にバイオフィルム形成が促進
�Ac-di-GMPはアロステリックにPgaC-PgaD複合体の形成及び糖転移活性を制御する

Linke D, et al (2006)
Hartmann MD, et al (2012)
Ishikawa M, et al (2012)

細菌の細胞表層への分泌は、タイプI〜VIIIに分類される機構で行われる。この中で、タイプVに分類されるオートトランスポーターの中で、内幕をSec機構で分泌され、外膜をβバレル構造で通過して、付着繊維を作るものがある。Trimeric Autotransporter Adhesinを中心に紹介する。

Li H, et al (2011)

大腸菌べん毛モーターの集合と安定

Bange G, et al (2011)

タンパク質によるSRP-GTPase活性の分子的進化の構造的根拠

Terahara N, et al (2012)

K⁺駆動型べん毛モーターの発見

Brouns SJ, et al (2008)
Marraffini LA, et al (2010)
Seed KD, et al (2013)

CRISPR-Cas systemについて：
�@pre-crRNAはCascadeによって切断される
�ACRISPRはスペーサー上流の配列で自己・非自己を識別する
�Bコレラ菌のファージは宿主の抗ファージ系を無力化するCRISPR-Cas systemを持っている

Reith F, et al (2009)
Fairbrother L, et al (2013)
Wiesemann N, et al (2013)

金粒子を生産する細菌 Cupriavidus metallidurans：
�@C.metalliduransは毒性のある金イオン(III)をエネルギー依存的に還元して無毒の金粒子を作っている
�AC.metalliduransがチオ硫酸金(I)から作った金粒子は天然の金鉱物と似ている
�B金イオンによる重金属耐性関連遺伝子の発現制御

Hammond SM, et al (2001)
Matranga C, et al (2005)
Kwak PB, et al (2012)

RNA silencingの構造基盤Argonauteについて：
�@RISCに含まれるArgonaute-2というタンパク質がRNAiに大きく関わっていることが明らかになった
�ARISC内部のsiRNAが一本鎖になる過程にArgonauteが関与していることが明らかにされた
�BArgonauteのNドメインの機能を変異導入によって調べ、N末端ドメイン二本鎖の一本鎖化を行っていることがわかった

Nagai H, et al (2002)
Choy A, et al (2012)
Hubber A, et al (2010)

Legionella pneumophilaの感染：
レジオネラ菌のグアニンヌクレオチド交換因子RalFやオートファジー阻害因子RavZの働きと感染との関連が明らかになった。

Perez JT, et al (2010)
Vreede FT, et al (2011)
Medina RA, et al (2011)

インフルエンザウイルスのRNA転写・複製調節：
svRNAが転写から複製の切り替えを調節し、ウイルスRNAの複製はRdRpやNPのRNAへの結合が重要だがNPのオリゴマライズ活性は重要ではないことが明らかになった。

Wang JD, et al (2007)
Denapoli J, et al (2013)
Kanjee U, et al (2012)

(p)ppGppと複製伸長：
緊縮応答を制御するppGppが直接的に結合するターゲットが明らかにされている。

Pearce MJ, et al (2008)
Striebel F, et al (2010)
Maupin-Furlow J. (2011)

バクテリアにおけるユビキチン様タンパク質Pup：
細菌にも真核生物のようなタンパク質分解経路をもつものがある

Bowen D, et al (1998)
Lang AE, et al (2010)
Gatsogiannis C, et al (2013)

Photorhabdus IuminescensのABC型毒素：
この細菌はこん虫に感染して、細胞内に毒素を注入して殺す。毒素の働きと細胞内への注入機構が分かってきた。

Schaefer JK, et al (2011)
Parks JM, et al (2013)

水銀を有機水銀に変える細菌遺伝子が明らかになった。