Colloquim 2015

Paulose JK, et al (2016)
Thaiss CA, et al (2014)
Mukherji A, et al (2013)

腸内細菌と概日リズム：腸内細菌の増殖がリズムに依存して体重の増加にも関与する。本当？

Baraquet C, et al (2013)
Matsuyama BY, et al (2016)
Bush M, et al (2012)

FlhGの相互作用相手、緑膿菌FleQの構造・c-di-GMP結合・機能
�@c-di-GMPはFleQのWalker A motifに作用し、べん毛形成を抑制する
�A結晶構造と機能解析から明らかになった、c-di-GMPに依存したFleQによるバイオフィルム形成機構
�B細菌エンハンサー結合タンパク質（bEBP）の総説（かなりしっかり書かれている。図がわかりやすい）

Zickermann V, et al (2015)
Spero MA, et al (2015)
Verkhovskaya M, et al (2013)

呼吸鎖のNADH酸化酵素の全構造が、2010年くらいからバクテリアのものから決まりはじめ、酵母のミトコンドリア由来のComplex �Tの結晶構造も決められた。さらに、ほ乳類の牛の心筋ミトコンドリア由来の構造はクライオ電顕による単粒子解析によっても決定された。これら、最近の知見をまとめて見た。

Lutkenhaus J (2007)
Shen B, et al (2010)
Park KT, et al (2015)

Min System構成因子　MinCの役割
�@Min Systemに関するいつものreview
�AMinCNとFtsZの相互作用からZ-ring形成におけるMinCの役割を考察した
�BMinCとMinDからなるpolymerはMin functionに必要ではない

Pattanayak GK, et al (2014)
Kim YI, et al (2012)
Rust MJ, et al (2011)

代謝系によるシアノバクテリアの概日振動の制御
�@ATP/(ATP+ADP)の変化が概日時計をリセットさせる
�A酸化キノンシグナルは概日時計を制御する
�B代謝変化による概日時計への影響

Strahl H, et al (2015)
Thiem S, et al (2008)
Endres RG (2009)

バクテリアにおける化学受容体の局在
�@膜のカーブによる膜貫通タンパクの局在化
�A大腸菌における化学受容体クラスターの確率的集合
�B二量体の三量体による極化学受容体クラスター形成

Song T, et al (2008)
Schwechheimer C, et al (2014)
Schwechheimer C, et al (2015)

Outer Membrane Vesicles(OMV)形成機構
�@コレラ菌ではsRNAがOMV産生を調節する
�A外被構造と構成物がOMV産生を調節する
�BRグラム陰性菌のOMVの生合成と機能

Schalk IJ, et al (2001)
Nader M, et al (2011)
Faraldo-Go´mez JD, et al (2003)

グラム陰性菌による鉄イオンの取り込み：Pseudomonas aeruginosaがもつ外膜受容体FpvAの解析
�@FpvAはFe-free型シデロフォアと結合している
�Aシデロフォアの取り込みは単なる拡散によるものではない
�Bシデロフォアを介した鉄イオンの取り込みについての総説

Linser R, et al (2015)
Han J, et al (2015)
Xiao X, et al (2013)

脂質合成に関与する転写因子SREBPについての最新の知見
�@肥満等の治療につながり得るSREBP1の脂質代謝の新たな経路が生化学的実験から判明し、NMRを用いた解析からconformational flexibilityが発見された
�ACRTC2のSREBP1を調節することで肝臓の脂質代謝を制御する役割の発見
�B創薬標的になり得るとわかったSREBPに関する少し前の総説

Burg RW, et al (1979)
Arena JP, et al (1992)
Cully DF, et al (1994)

駆虫薬イベルメクチン/アベルメクチンの作用機序
�@アベルメクチンの発見：ノーベル賞にむすびつく発見
�Aアベルメクチンのターゲットは、グルタミン酸作動性クロライドチャネル
�Bアベルメクチン感受性グルタミン酸作動性クロライドチャネル（GluCl)のクローン化をした

Hu CM, et al (2015)
Anselmo AC, et al (2014)
Modery-Pawlowski CL, et al (2013)

ナノテクノロジー（ナノパーティクル）の話
�@ナノ生物工学：ナノ粒子を血小板膜で覆うことによる生体界面の作製
�A血小板のようなナノ粒子：形状、柔軟性、および血管の傷害をターゲット にした血小板の表面の模倣
�B合成血小板類似体へのアプローチ

Sakurai T, et al (1998)
Hara J, et al (2001)
Yin J, et al (2015)

Orexin（オレキシン）の話：最近のオレキシンの話は、Antagonistの探索（創薬につながる）、オプトジェネティック（sleep/wakeのスイッチになる因子の探索）の話が多い
�@オレキシンとオレキシン受容体の発見
�Aオレキシンは睡眠に関わっていた（ナルコレプシーの原因）
�BオレキシンOX2とスボレキサント（睡眠薬）の共結晶構造が解けた

Chen AH, et al (2015)
Nakajima M, et al (2005)
Cohen SE, et al (2015)

シアノバクテリアの概日リズムの移植

Rees DC, et al (2009)
Moeller A, et al (2015)
Perez C, et al (2015)

P型ATPaseタイプのフリッパーゼの構造と機能

Rapp M, et al (2007)
Seppa¨la¨ S, et al (2010)
Woodall NB, et al (2015)

膜蛋白質のトポロジーとその進化の話し：EMrEタンパク質について

Lori C, et al (2015)
Abel S, et al (2013)
Tsokos CG, et al (2012)

コーロバクターではc-di-GMPがDND複製・細胞形態形成を制御する
�@c-di-GMPが染色体複製を駆動する
�Ac-di-GMPを合成しないCaulobacter変異体の解析
�BCaulobacterの非対称分裂についての総説

Paulick A, et al (2015)

Shewanella oneidensis MR-1鞭毛モーター内での二種の固定子ダイナミクス

Espinosa J, et al (2015)

RpaBと概日時計間の応答と相互作用

Uehara T, et al (2008)
Cho H, et al (2014)
Typas A, et al (2011)

β-lactam antibioticsによる細胞壁合成阻害と合成産物の分解

Shirane M, et al (2006)
Mannan AU, et al (2006)
Chang J, et al (2013)
Raiborg C, et al (2015)
　　　　　　 　　　　　　　　　

神経突起形成因子Protrudinとメンブレントラフィック：
�@メンブレントラフィックを介して神経形成を行う因子Protrudinの発見
�@’AD-HSP（常染色体優性遺伝性痙性対麻痺）の原因遺伝子として同定されたZFYVE27(=Protrudin)
�AProtrudinは小胞ネットワーク形成を制御する
�BメンブレントラフィックにおけるProtrudinの役割

Bath C, et al (1998)
Pietila¨ MK, et al (2013)
Hong C, et al (2015)

高度好塩菌に特異的に感染するウイルスHis１:脂質修飾タンパク質が生み出す構造の柔軟性

Nikolova EN, et al (2011)
Kimsey IJ, et al (2015)
Nikolova EN, et al (2013)

一過性の塩基対の構造の可視化〜ワトソンクリック型とフーグスティン型〜：RD法と最新のシミュレーションを用いることで、一過性の塩基対の存在が確認でき、その動的な構造変化の検出により、塩基のミスペアーを説明することに成功した。

Heler R, et al (2015)
Nunez JK, et al (2015)
Barrangou R, et al (2014)

CRISPR-Casシステムについて、とても最近の話,；Cas9は標的配列の切断だけでなく、外来配列の認識にも重要,スペーサー配列獲得の際の詳細な分子機構

Hegde RS, et al (2011)
Rome ME, et al (2014)
Wang F, et al (2014)

GET pathwayによってTAタンパク質を小胞体膜へ埋め込むメカニズム；Get3がどの状態の時にGet1/2複合体と結合するのかが明らかにされ、Get1/2複合体がTAとの結合に必要と思われる一部が明らかにされた

Gavrish E, et al (2014)
Ling LL, et al (2015)

新規抗生物質の話：微生物が産生し、他の微生物など生体細胞の増殖や機能を阻害する物質の総称。様々な構造を持つものがあるが、今回は環状のペプチド構造を持つものの話。だいたい新しい抗生物質の話は新規の菌にStaphylococcus aureus（黄色ブドウ球菌）やMycobacterium tuberculosis（結核菌）をかけて、阻止円が出来るかという形。